воскресенье, 30 июня 2019 г.

Как я нашел родственников в США

Есть ли у вас родственники в западных странах? Среди моих знакомых многие говорят, что когда-то давно в какую-нибудь революцию или во время боевых действий или просто в мирное время их дальний предок эмигрировал в США/Канаду/Германию/Австралию... Сейчас конечно ни они ни их родственники ничего не знают о судьбе или о потомках эмигранта, т.к. связь давно утеряна, но, разумеется, хотели бы получить хоть какую-то информацию.
В моей семье тоже есть такая история. И в далеком 2011 я попробовал разобраться и найти информацию о предках эмигрантах. Тогда мне еще не были известны ДНК тесты, но даже если бы я про них знал, это бы не помогло поиску.
В этом посте будет история о том как я нашел своих (потенциальных) родственников в США и какие я использовал для этого инструменты. К сожалению, найденные родственники не разделяют мой большой интерес к генеалогии, однако, может вам повезет больше.
Предыстория
Изначально у меня была следующая информация:
Когда брат моей прабабки Сергей был маленьким мальчиком, его во время революции вывез поп в Америку. 
Ни девичьей фамилии прабабки, ни даже ее имени, ни в какую именно революцию, ни почему вдруг поп решил  вывезти Сергея и уж тем более куда именно в Америку известно не было. Плюс некоторые родственники неохотно делились информацией про этот случай. Вроде бы даже у одних родственников была фотография с Сергеем из США с адресом на обратной стороне, но они ее даже не дали посмотреть.
Еще мне был известен регион, где родилась прабабка - знал что она из какой-то деревни недалеко от города Камышин Волгоградской области и была известна деревня рождения моей бабушки - дочки искомой прабабки.
Начало поиска
Первым делом нужно было узнать девичью фамилию и имя прабабки. Для этого я обратился в архив ЗАГСа Волгоградской области. Оказывается, документы хранятся в ЗАГСе в течение ста лет с момента их создания. Документы старше ста лет передаются архивам. В ЗАГСе я смог узнать имя моей прабабки - Феодосия. Это было сделано благодаря записи 1926 года о рождении моей бабушки. Девичьей фамилии прабабки в записи не было, как не было и записи о браке между прадедом и прабабкой. Стало понятно, что дальнейший поиск надо вести по архивам. Также я узнал, что до революции 1917 года записи о браках, рождениях и смертях вели церкви, после 1917 года эту функцию взяли ЗАГСы. Церкви заполняли документы, называемые метрическими книгами. По опыту поиска на каждый год в церкви велось три книги - о рождении, о смерти и о бракосочетании.
Просмотрев несколько метрических книг в архивах для села Гуселка (село в котором родилась бабушка) была найдена запись о бракосочетании моего прадеда и прабабки. Девичья фамилия прабабки оказалась Дубровина и родилась она в селе Смородино недалеко от села Гуселка.
Далее начались поиски по метрическим книгам села Смородино - хотелось найти запись о рождении прабабки, чтобы узнать ее родителей и параллельно велись поиски ее братьев и сестер.
И вот снова удача - мне и моей маме удалось найти записи о рождении Феодосии, запись о браке ее родителей, запись о рождении Сергея Дубровина (который, якобы, и уехал в США с попом) и еще записи о рождении Георгия и Евдокии Дубровиных - брата и сестры моей прабабки и Сергея.
Согласно метрических книг Сергей родился в 1885 году и вот тут с семейными данными выходит нестыковка - на период детства Сергея никаких революций не было. Если взять революцию 1905-1907, то на тот момент ему уже было 20 лет.
На некоторое время поиски остановились. Было непонятно откуда взять информацию о списках россиян, отправившихся в Америку и существовали ли такие списки вообще.
Новые данные
После продолжительных разбирательств о том, существуют ли в России списки уехавших в Америку граждан, я решил переключиться на поиски списков иммигрантов в США. Первым сайтом, куда вывел гугл был https://www.libertyellisfoundation.org/. В разное время в Америку иммигрировала куча народу. Многие из них прибыли на кораблях и прошли регистрацию на острове Эллис. Теперь регистрационные документы острова доступны на упомянутом сайте совершенно бесплатно. Плюс к этому рукописные записи сотрудников миграционной службы оцифрованы и внесены в базу, по которой можно удобно искать своих эмигрантов.
На данный момент на сайте реализован очень удобный поиск. Мне особенно понравилась функция "Звучит как".
Не помню была ли эта функция в 2011 году, но тогда я вбивал фамилию Dubrovin и не находил никаких похожих совпадений. Но один раз я вбил DubroWin и:
Сложно передать восторг от найденной записи, тогда это казалось безумно круто - да я нашел родственника, который 100 лет назад непонятно почему уехал в Америку. Совпало все - имя, фамилия и та самая деревня Смородино, которая в записях числится как Samorodina -  видимо, записывали просто на слух, поэтому получилось не так точно. На сайте я также увидел скан документов регистрации прибывших в порт. Кроме фамилии, имени и происхождения таблица содержит возраст, рост, профессию, цвет глаз и волос прибывшего, а также к кому он приезжает и самый близкий родственник, оставшийся на родине. Помимо моего родственника из той же деревни Смородино приехали еще 3 человека - Степан Булатов, Федот(р) Попов и Стачар Смирнов. Звали ли Смирнова действительно Стачар или же это исковерканное русское имя я не знаю.
И вот тут я вспомнил, что по предыстории Сергей уехал в Америку с попом. Видимо, Попов, приплывший с моим родственником стал попом при пересказе истории об эмиграции из поколения в поколение. Плыли все на корабле Джордж Вашингтон, а отправлялись в штат Мичиган.
Церковь и геналогия
Казалось, до заветного знакомства с родственниками осталось пара кликов. Я начал активно искать всех Дубровиных в Мичигане на сайтах с телефонными номерами - таких куча, если вбить в гугл "yellow pages". Потом звонил по каждому найденному номеру по скайпу и узнавал не были ли у бравших трубку родственники эмигрантами из России. Люди воспринимали мои звонки нормально - никто не нагрубил и не послал, однако про Сергея Дубровина никто ничего не знал.
После продолжительного поиска в гугле я нашел сайт www.familysearch.org/. Но сначала меня постоянно направляло на ancestry.com, а любой вариант подписки на ancestry я на тот момент позволить не мог. Сайт www.familysearch.org/ принадлежит церкви "Иисуса Христа Святых последних дней". В России данная церковь больше известна как "мормоны" - молодые люди и девушки обычно ходят парами с именами на бейджиках и с американским акцентом предлагают всем обратиться в их веру или просто почитать всякие книжки. Оказывается мормоны очень трепетно относятся к своему происхождению и хорошо знают свои семейные древа. Более того, компания из которой произошел сам ancestry.com изначально также была основана  мормонами. На www.familysearch.org можно искать по всяким базам совершенно бесплатно, но их там конечно не так много как у ancestry.com.
Вбивая Dubrovin, Dubrowin и вариации я ограничивал поиск по штату Мичиган, однако опять не выходило ни одного результата с именем Сергей.
Результаты постоянно выдавали некоего George Dubrovin (Dubroven и вариации). В какой-то момент поиска я все-таки зашел на профиль George Dubrovin и понял, что это Сергей.  Совпадали года рождения и иммиграции а также страна происхождения - Россия. Стало понятно, что Сергей сменил имя на Джордж, возможно потому, что плыл на корабле George Washington. Конечно истинных причин смены имени мне не узнать теперь никогда, но все же версия просто взять имя корабля, который привез тебя в новый мир довольно правдоподобна.
На картинке далее фрагмент документа американской переписи населения 1920 года.
У Джорджа была жена Алекс (Александра Дубровина тоже из России) и три родившихся в Мичигане сына - Джон, Алекс и Виллиам.
Это была еще одна маленькая победа. Я тогда подумал, что у трех сыновей в любом случае должны быть дети, но как потом показало мое расследование, к сожалению, ни один из них не стал отцом.
Конец
На момент моих поисков (2011-2012) я знал, что Алекс Дубровин все еще был жив, тогда как его братьев как и родителей уже не было - на том же  www.familysearch.org можно искать по индексу американских смертей.
Я смог узнать номер телефона Алекса и позвонить - на том конце молчали, потом номер стал недоступен. Впоследствии я узнал, что Алекс очень застенчив и живет толи с сиделкой толи с кем-то еще, которая экранирует его от внешних контактов. Я послал Алексу письмо обыкновенной почтой - но никакого ответа не получил.
Информацию о том, что Алекс застенчив а также другие интересные данные о семье Дубровиных я узнал с помощью потомков Степана Булатова. У Степана было двое детей, которые также вступили в брак и родили детей. Короче, ветка Степана продолжила рост - было весьма просто их отыскать.
Сейчас, я дружу с потомками Степана в фейсбуке, однако, они не разделяют мой интерес к генеалогии.
Мораль моей истории в том, что если вы хотите кого-то найти, то все в ваших руках, дерзайте!

воскресенье, 24 июня 2018 г.

Результаты ancestryDNA

Хочу извиниться перед читающей меня аудиторией, или перед теми кто когда-то меня читал, за длинный перерыв и отсутствие постов. Два года сюда не заходил. Причиной стали житейские дела - все свободное время уходило на учебу. Но мой интерес к теме о ДНК никуда не пропал, надеюсь, и ваш тоже. В этом посте я расскажу о результатах теста AncestryDNA. Вкратце, AncestryDNA меня не впечатлил.
На главной странице личного кабинета сайта есть три больших блока.
В первом блоке - DNA Story показан предполагаемый этнический состав ваших предков. Мне, например, определили, что 96% моих потенциальных предков из Чехии, Словакии, Польши и Литвы и только 2% из Финляндии и России. Хотя я и не очень глубоко знаю происхождение своей семьи, такая картина мне кажется странной. В 23andme эта часть называется Ancestry Composition и там мне нашли гораздо больше разных регионов происхождения предков. Возможно, не стоит опираться на собственные догадки о происхождении, но Ancestry Composition от 23andme кажется для меня более правдоподобной. На картинках ниже слева результат AncestryDNA, справа 23andme.

Такая разница в предсказанных результатах объясняется разным подходом компаний к расчету этнического состава. Обе компании сравнивают ДНК людей с известным происхождением с вашими результатами. Но вот базы данных из которых компании берут ДНК для сравнения отличаются. AncestryDNA сравнивает ваши данные с ДНК трех тысяч людей разного происхождения (подробнее на самом сайте AncestryDNA). Все 3000 образцов разделены на 26 регионов (таблица с регионами на сайте). Любопытно, что Финляндия/Россия это один регион в классификации и на него приходится всего 59 образцов, плюс в регионе "Восточная Европа" с 432 образцами нет России. Видимо, именно из-за такого маленького количества сравниваемых образцов для России AncestryDNA рассчитал мне такую странную картину происхождения предков. Что же касается 23andme, то они используют 11 091 образец со всего мира плюс ДНК из двух научных проектов (Human genome diversity project и 1000 Genomes project). Короче говоря, выходит, что происхождение от 23andme гораздо точнее, хотя бы исходя из того, что база для сравнения ДНК у них, как минимум, в четыре раза больше чем у AncestryDNA.
В блоке DNA Story есть также предполагаемая история, как я оказался в месте прохождения теста. Так как я хитро отсылал свои результаты через shipito, как будто я нахожусь в США, AncestryDNA считает, что мои предки из Польши, Литвы и прочих соседних стран иммигрировали в Америку в 1875-1900 и далее в начале XX века обжились где-то в районе великих озер и Нью-Йорка.
Как вы, наверно, догадались это неверная догадка - ни по поводу предков из Польши ни по поводу иммиграции в США.
Во втором большом блоке DNA Matches, как понятно из названия, находятся потенциальные родственники. Основным преимуществом базы AncestryDNA является ее размер. Из всех компаний, предоставляющих ДНК тесты у AncestryDNA самая большая база. Согласно таблицы отсюда, на май 2018 у AncestryDNA в базе уже свыше 9 миллионов человек, тогда как у 23andme только 5 миллионов.
Что касается поиска и сравнения потенциальных родственников, то можно искать по фамилии и месту. Зайдя в профиль интересующего родственника можно увидеть людей с которыми у вас с интересующим родственником имеются общие родственные связи (общие участки ДНК). Сколько всего родственников нашлось в AncestryDNA я нигде увидеть не смог - доступен только список родственников. Никаких сравнений по участкам хромосом как в 23andme с потенциальными родственниками нет. Вообще никаких упоминаний про хромосомы на сайте не видел.
Сам сайт ancestry.com очень мощный ресурс для генеалогического поиска особенно для США. Можно искать по куче различных баз - переписи населения, газеты, списки пассажиров - чего там только нет. Но все преимущества ancestry.com доступны только по платным подпискам. Кроме этого некоторые пользователи создают генеалогические деревья в ancestry, но опять - чтобы посмотреть деревья пользователей нужно купить подписку. Цены на подписки не очень радуют.
Третий большой блок DNA Circles в моем случае пустой. Если вы хорошо знаете свое генеалогическое дерево и создали его на ancestry а также связали дерево с ДНК тестами, то есть шанс попасть в ДНК круг в случае если будут общие ветви в вашем и чужих генеалогических деревьях. Подробно данный блок описать не могу, т.к. у самого таких кругов нет. На форумах по ДНК генеалогии многие считают круги бесполезными.
Кроме трех упомянутых блоков на главной странице личного кабинета есть приглашение поучаствовать в различных опросниках, результаты которых будут использоваться в научных исследованиях.
И последнее - в 23andme недавно появилась функция поделиться ссылкой на свои результаты. Вот, например, как выглядит информация по этническому составу предков для моего профиля - мой профиль 23andme. Если я захочу похвастаться своим богатым происхождением, достаточно одной ссылки и все откроется на отдельно созданной странице на сайте 23andmeAncestryDNA предлагает мне сохранить на выбор 3 файла картинки разного размера с моим результатом. Какие блин картинки, на дворе 2018 год!


Итог
AncestryDNA - самый худший вариант генетического теста из всех, что я пробовал. Информация по этническому составу, как мне представляется (на 100% не могу быть уверенным), очень далека от истины, потому что база для подсчета этнического состава очень маленькая, и в моем случае почти не включает интересные для меня регионы.
Поиск родственников ничем не выделяется, отсутствуют любые инструменты для сравнения участков хромосом.
Функция DNA Circles в моем случае никакой информации не дает.
Везде, где может быть потенциально интересная информация по родственникам сайт предлагает купить подписку.
Не понимаю, откуда берутся положительные отзывы на этот продукт, и почему у них столько клиентов. Видимо, ancestry самый популярный из всех подобных сервисов и людям просто не с чем сравнивать. AncestryDNA это красивая обертка, модный сайт, все гладко работает, но внутри скудный набор бесполезных инструментов.
Если вы хотите сделать себе ДНК тест, лучше остановиться на 23andme.

четверг, 7 июля 2016 г.

Опыт заказа ancestry DNA

После недавних комментариев о том, что компания 23andme перестала принимать наборы, присланные не из страны, в которую они покупались, я решил попробовать сделать генетический тест так, будто я нахожусь в США. А именно заказать набор на американский адрес и отправить его в лабораторию по входящей в комплект предоплаченной доставке.
Так как, результаты 23andme у меня уже есть, причем как для меня так и для моих родителей и некоторых родственников, я решил попробовать тест ancestryDNA. Сразу оговорюсь, способ, который я тут раскрою, не сработает с 23andme, но с ancestryDNA у меня все прошло гладко.
Был приятно удивлен, что база ancestryDNA больше 23andme, считав до этого последнюю абсолютным лидером на рынке ДНК тестов.
Пара слов о компании ancestry.com, продуктом которой является ancestryDNA:
Ancestry.com это самая большая компания, предоставляющая генеалогические услуги, в мире, дислоцируется в штате Юта, который многим известен мормонами. Мормоны это представители церкви Иисуса Христа и святых последних дней (LDS), приходы которой находятся по всей России. Вы могли встречать миссионеров-мормонов на улице, обычно это молодые люди или девушки 19-24 лет, приезжающие на два года из США чтобы проповедовать.
История ancestry.com тесно связана с церковью LDS - так, первый продукт компании основан на записях мормонов, очень трепетно относящихся к своей генеалогии.
В данный момент, судя по сайту, база ancestryDNA насчитывает более 2 миллионов образцов, что весьма внушительно.
Помимо ancestryDNA, компания предоставляет продукты для генеалогических исследований. По платной подписке вы получите доступ к куче всевозможных баз, например, переписям населения в США, базам натурализации, смертей, браков и многих многих других. Базы постоянно обновляются.
Заказ теста
Тест ancestryDNA стоит 99 долларов, в отличие от 199 долларов для 23andme. Пройдя по этой ссылке, вы сможете купить ancestryDNA за 89 долларов.
При заказе набора в страну не из этого списка: 
придется воспользоваться почтовым форвардером. Я для этих целей, как и для отправки обратно, использовал shipito.com
После регистрации в shipito.com у меня появился почтовый адрес в США, на который я и заказал набор ancestryDNA. Чтобы отправить набор в Россию из шипито использовал доставку Boxberry Local Pickup, которая мне обошлась в 23 доллара.
Набор 23andme через почтовых форвардеров заказать нельзя, т.к. судя по постам с форума molgen, компания не отправляет тесты на их адреса, однако можно попробовать услугу "помощь в покупке" -> "покупка через посредника" в shipito.
Прохождение теста
Набор ancestryDNA включает пробирку со штрих-кодом, который необходимо ввести в своем личном кабинете на dna.ancestry.com, тем самым привязав образец к своему аккаунту, инструкцию по выполнению теста, небольшую коробку с предоплаченной доставкой и полупрозрачный пакетик с куском адсорбера.
Процедура сбора анализа очень проста - минимум за 30-60 минут до сбора слюны нельзя есть, пить, курить, жевать жвачку и вообще лучше ничего не класть в рот. После такого "воздержания" надо поплевать в пробирку, чтобы слюна дошла до указанного уровня. Дальше нужно закрыть пробирку идущим в комплекте колпачком, в котором находится консервирующая слюну жидкость.
В отличие от 23andme, на наборе ancestryDNA я не нашел информации о сроке годности или дате выпуска пробирки.
Отправка теста в лабораторию в США
Чтобы послать набор обратно из России и симулировать отправку из США я сделал следующее:
сначала я отправил коробку с пробиркой на свой американский адрес в шипито, затем когда моя слюна дошла,
заказал на шипито специальный запрос следующего содержания:
1 Open the blue envelope.
2 You will find a small white box with USPS shipping label on it inside the blue envelope.
3 Return the box with the USPS shipping label provided
За два дня мой запрос выполнили, цена обработки составила 12 долларов - 5 долларов специальный запрос + 2 доллара обработка отправления + 5 долларов - ускоренная обработка.
И через день после выполнения запроса я наблюдал путешествие посылки по США от шипито в лабораторию в Юте.
Примерно через 2 дня после того, как согласно трек-номеру посылка была доставлена, мне пришел имейл от ancestry:
Теперь в своем аккаунте я вижу следующую картинку:
Резюме
Итого на тест я потратил:
134 доллара (99 сам набор + 23 отправка в Россию + 12 обработка специального запроса)
1500 рублей отправка EMS почтой на свой адрес в шипито.
Всего (по курсу 66 рублей за доллар) - 10 344 рубля.
Можно сэкономить 5 долларов на специальном запросе и не делать его ускоренным, также 10 долларов можно сэкономить, заказывая тест по ссылке, ну и отправлять в Америку можно было обычной почтой за 500-600 рублей.
Итого, проходя тест максимально экономно, можно уложиться в 8400 рублей.
По времени, с момента оплаты мной набора до имейла, что пробирка получена прошло 56 дней. Однако я не особо торопился отправлять набор на разных этапах его путешествия.
Думаю, если стараться все делать очень быстро, можно уложиться в 40-45 дней.
Ждем первых результатов теста...

воскресенье, 1 ноября 2015 г.

Сайт 22andxy расшифровка результатов генетических тестов

Давно сюда не писал - был занят созданием сайта для расшифровки 23andme.
На днях 23andme заявила, что возобновит предоставление результатов по здоровью для своих клиентов, однако результаты будут не столь полны как раньше т.к. FDA разрешила давать данные только по определенным заболеваниям. Цена теста подскочила до 199 долларов.
Я давно хотел сделать сайт по расшифровке, аналогичный promethease или athletigen только на русском языке и чтобы можно было использовать результаты не только 23andme но и других фирм. И вот мой сайт начал работать. Конечно пока там не так много контента и программная часть не совсем удобная, да и дизайн оставляет желать лучшего, но главное - начало положено. Буду по мере возможности что-то исправлять и улучшать.
В примере расшифровки можно посмотреть по каким SNP, что определяется. Если зарегистрироваться, и в разделе "Мое ДНК" вручную указать генотип в некоторых своих SNP, то в "ДНК особенности" появится таблица, как в примере расшифровки только для вас.
О всех ошибках, неточностях, пожеланиях и предложениях пишите мне в группу или в комментарии к этому посту.
Также начал записывать видео на youtube с обзорами 23andme, планирую развить канал на тему генетики.
Пока видео конечно скучноваты, но я думаю, как сделать следующие записи веселее)


вторник, 1 сентября 2015 г.

Генетика ожирения: не за горами генная терапия против лишнего веса

Говоря об ожирении, в основном все вспоминают США. И, конечно, не зря, в этой стране граждане с лишним весом составляют примерно 1/3 от всего населения, тогда как в России примерно 1/4, что тоже очень много. Ожирение сокращает продолжительность жизни, увеличивает вероятность диабета и сердечных заболеваний. Думаю, многие ждут чудес от генетической инженерии, которая, безусловно, поможет нам справляться с лишним весом быстро и естественно, и предпосылки к чудесам постепенно начинают появляться...


В данный момент найдено несколько генов, возможно отвечающих за склонность к избыточному весу. Открытый в 2007 ген FTO (fat mass and obesity associated - переводится как "связанный с количеством жира и ожирением") активно исследуется, т.к. согласно многим трудам, именно он бесспорно влияет на склонность к ожирению.
На сегодняшний день пока не ясен механизм по которому FTO влияет на избыточный вес. Некоторые ученые полагают, что ген регулирует склонность к обжорству и потреблению высококалорийной пищи и вообще, что ген как-то влияет на наш мозг, который принимает решения, приводящие к ожирению. В исследовании "Cohort of birth modifies the association between FTO genotype and BMI" установили что FTO по разному определяет склонность к ожирению у людей родившихся до и после Второй Мировой. Одним из возможных объяснений является то, что до Второй Мировой люди были более подвижны и всё негативное влияние гена FTO за счет физической активности значительно снижалось.
И вот недавно совместными усилиями ученых из Harvard и MIT мы, возможно, немного приблизились к пониманию как работает FTO. Как показало их исследование, неблагоприятная версия гена FTO способствует сохранению энергии из пищи в клетках в виде жира.
Участки FTO регулируют деятельность генов IRX3 и IRX5, которые, если включены, заставляют клетки сохранять энергию. Если IRX3 и IRX5 не работают, вероятность ожирения снижается. Из полученных данных следует, что для некоторых людей вероятность избыточного веса определяется не их особенностями диеты или тем, как активно они занимаются спортом, а именно склонностью клеток сохранять жир.


С помощью современных технологий можно искусственно отключить IRX3 и IRX5 и, теоретически включить механизм сжигания жира в клетках. Эксперименты на мышах показали, что вес животных с включенным IRX3 при высококалорийной диете на 15% выше, чем у подопытных с выключенным геном. Все это дает надежду, что скоро лишние килограммы можно будет убрать уколом или таблеткой, стимулирующими естественное сжигание жира.
Проверить активность IRX3 и IRX5 по данным 23andme можно с помощью rs1421085.
Каждая копия C увеличивает активность вредных генов.

вторник, 25 августа 2015 г.

23andme и тесты на отцовство

Одним из популярных поисковых запросов на тему генетических тестов является "тест на отцовство".



Но можно ли использовать услугу 23andme или подобной компании, например ftdna, для определения отцовства? Как определить отцовство дешевле и быстрее всего и насколько можно верить результатам? На эти вопросы я и попробую ответить в этом сообщении.
Вообще чтобы определить являются ли два человека родственниками, необходимо сравнить их ДНК хромосому за хромосомой. Если какой-то минимальный процент совпадает, то людей можно считать родственниками. Какой именно минимальный процент указывает на родственную связь - пока, думаю, не до конца разрешенный вопрос. В 23andme у моего самого дальнего потенциального родственника 0.12% общей по тесту со мной ДНК, тогда как с моим самым близким родственником, прошедшим тест - моей мамой у меня совпадает 50%. Но все наше ДНК это 3 миллиарда пар нуклеотидов, определить какой нуклеотид находится в каком месте во всех 3 миллиардах позиций очень дорого. 23andme и подобные дают сводку по нескольким миллионам позиций генома (конкретно 23andme укажет нуклеотиды в 5 миллионах позиций генома).
Компании, занимающиеся непосредственно тестами на отцовство, сравнивают определенные участки ДНК - маркеры. Если маркеры совпадают, делается соответствующее заключение о родстве.
Традиционные способы установления отцовства отличаются по количеству рассматриваемых маркеров. Наиболее популярными методами установления отцовства являются "полимеразная цепная реакция (ПЦР)" и "полиморфизм длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ)", хотя есть конечно и много других.
ПЦР современнее и быстрее ПДРФ. Обычно ПЦР занимает 3-9 дней и требует небольшое количество ДНК-материала для опыта - можно использовать мазок с внутренней стороны щеки, любые клетки, однако при этом способе сравниваются участки ДНК небольшого размера и тестируется обычно 6-9 участков ДНК, что меньше чем у ПДРФ.
ПДРФ более достоверный чем ПЦР метод установления отцовства, но он требует больше генетического материала, поэтому тут, возможно, придется сдавать кровь, хотя современные технологии ПДРФ позволяют сделать тест и по мазку с внутренней стороны щеки. ПДРФ обычно занимает 10-14 дней.
Конечно фирмы, предоставляющие тесты на отцовство, могут и не называть вам применяемого метода, но если тест занимает меньше 10 дней и кровь не требуется, скорее всего, применяется менее точный ПЦР.
Точность определения отцовства в 23andme и подобных составляет 100% - вы можете сравнить каждую хромосому и увидеть сколько процентов ДНК совпадает. Для родитель-ребенок совпадает 50% ДНК, бабушка/дедушка-внук совпадает 25% ДНК. Короче для ближайших родственников определить родство можно очень точно, относительно быстро и за ту же цену, что нельзя сказать о традиционных способах определения родства. Точность тут снижается а цена повышается.


Если вы хотите предварительно прикинуть являются ли два человека родителем и ребенком, можно рассмотреть группу крови исследуемых лиц. В таблице показаны возможные группы крови ребенка при различных сочетаниях групп крови отца и матери. Если у потенциальных матери с отцом первая группа крови, а у ребенка вторая, то, скорее всего, надо рассмотреть другого потенциального отца или мать. Если у потенциальных родителей первая и вторая группы крови, тут без теста на отцовство не разобраться, т.к. у ребенка может быть любая группа.
Группа крови ребенка
Группа крови отца
II(A) III(B) IV(AB) I(O)
Группа крови матери
II(A) A/O A/B/AB/O A/B/AB A/O
III(B) A/B/AB/O B/O A/B/AB B/O
IV(AB) A/B/AB A/B/AB A/B/AB A/B
I(O) A/O B/O A/B O

Рассмотрим, представленные на рынке, фирмы, определяющие отцовство.
Сравнивать различные компании, оказывающие услуги установления отцовства, будем по следующим критериям:
-Цена
-Скорость выполнения
-Предоставление юридически значимых документов по результатам теста - очень важно для всяких судов
-Анонимность - можно ли сделать тест без ведома потенциального ребенка или отца - важно, например, для мам, которые не уверены точно от кого родили, но не хотят выставлять свои сомнения напоказ
-Распространяемость - насколько можно распространить результаты на другие отрасли, тут безусловными лидерами будут 23andme и ftdna.
Сравнивать будем следующие фирмы:
-23andme
-ftdna
-инвитро - на мой взгляд, довольно дорогая компания, но отделения есть по всей России и Украине.
-Диалайн - Волгоградская фирма установления отцовства - думаю похожая есть в любом другом городе.
С нынешним курсом доллара выигрывает типичная фирма типа диалайн, оказывающая услуги теста на отцовство. Со стороны юридической применимости ДНК теста любая отечественная фирма предлагает необходимые для суда документы, тогда как в 23andme и ftdna можно получить только информацию. Хотя на сайте ftdna предлагается воспользоваться услугами dnafindings, полученные в которой документы, можно применить в международных спорах.
Что касается анонимности, на рынке можно найти анонимный тест в российской фирме в пределах 20 -25 тыс. руб. в зависимости от региона. Видимо из-аз страха перед определенными законами, в диалайн отказываются делать тест по генетическому материалу, отличному от крови, но, полагаю, это исключение. 23andme и ftdna предоставляют средний уровень анонимности - вы не можете отправить на тест волос или окурок, нужно взять пробу слюны или мазок с внутренней стороны щеки, что не всегда можно сделать, не вызывая подозрений. Также при проведении теста 23andme или ftdna, вы получаете данные, которые можно использовать и для определения особенностей здоровья и для поиска родственников плюс, если придется столкнуться с определением отцовства повторно, например когда у ребенка 3 потенциальных отца, можно сделать тест для ребенка и для кого-то из возможных отцов, если результат окажется отрицательным,  доплатить 100$, сделав тест для второго возможного отца - не надо платить несколько раз по 20 тыс. руб.
Результаты сравнения сведены в таблицу.

23andme ftdna инвитро диалайн
Цена* 230$ 200$ 40-60 тыс. руб. 15-30 т.р.
Скорость
выполнения
1.5-2 месяца 2-2.5 месяца ускоренный -
до 8 дней
до 30 дней
Юридическая
применимость
Нет Есть, но на отдельном
сайте за отдельную плату (425$),
в РФ скорее всего
неприменимо
Есть Есть
Анонимность Средняя Средняя Высокая,
по необходимости
Нет
Распространяемость Высокая Высокая Отсутствует Отсутствует

*Цены указаны на август 2015

Вообщем оставайтесь верными друг другу, чтобы вопрос отцовства вас не волновал.

воскресенье, 2 августа 2015 г.

Интеллект определяет продолжительность жизни

Научные исследования на тему умственных способностей показывают, что у людей с высоким уровнем интеллекта выше продолжительность жизни. Однако пока не до конца ясна причина такой корреляции. Возможно умные люди имеют социальный статус, который позволяет им лучше следить за здоровьем, а возможно что в таком совпадении замешана генетика, влияющая и на интеллект и на долголетие, а может вообще все сразу. 
Причину корреляции и попытались выяснить авторы недавно опубликованной научной статьи "The association between intelligence and lifespan is mostly genetic".
Исследуя однояйцевых и многояйцевых однополых близнецов, ученые выяснили, что связь между интеллектом и продолжительностью жизни на 95% регулируется генами.


После анализа данных было установлено, что более смышленый близнец обычно живет дольше. Причем данная тенденция была более явной у многояйцевых близнецов.
Тем не менее связь между интеллектом и продолжительностью жизни хоть и есть, но очень мала, поэтому при наличии большого IQ не спешите обзаводиться вредными привычками.
Автор работы Rosalind Arden считает, что гены делающие нас умнее, делают нас более здоровыми.
Безусловно, требуются дальнейшие исследования для установления деталей явления.
23andme предоставляет следующий SNP для характеристики интеллекта:
rs363050 - AG - обычный IQ, AA - IQ в среднем выше на 3-4 пункта, GG - IQ на 3-4 пункта ниже чем у AG. 
Авторы исследования, где участвовали данные rs363050 оценили влияние данного параметра на разброс в значениях IQ всего в 3,4%, поэтому серьезно к этим данным относиться не стоит. Исследовались данные индивидов с европейским происхождением.